Для разработки темы использованы источники делопроизводственного архива Днепропетровского исторического музея (отчеты, воспоминания) и государственного архива Днепропетровской области (отчеты, приказы).
После начала Великой Отечественной войны — летом 1941 г. музейными сотрудниками были эвакуированы наиболее ценные экспонаты запорожского, церковно-скифского отделов и отдела европейской культуры. Однако огромное количество ценнейших коллекций, главным образом, из отдела археологии, осталось в Днепропетровске.
25 августа 1941 г. Днепропетровск был занят немецко-фашистскими захватчиками. В сентябре 1941 г. исторический музей начал свою работу при оккупационном режиме. Директором музея был назначен бывший сотрудник музея П.А. Козар. Из прежних 30 сотрудников остались трое (М.Я. Белый, Я.Н. Белая и П.К. Дузь). Новоизбранный штат музея приступил к учету экспонатов. Переинвентаризации подлежали фонды и экспонаты, которые размещались в экспозиционных отделах. Эта работа проводилась до 1 апреля 1942 года.
Весной 1942 г. (апрель — май) из-за того, что в здании исторического музея устраивалась резиденция штадткомиссара Клостермана, экспонаты исторического музея были перевезены в здание художественного музея (ул. Шевченко, 21). Во время переноски экспонатов часть их была разграблена немцами и населением. Но наиболее ценные экспонаты были спрятаны — зарыты в землю, помещены в недействующие котлы — сотрудниками музея. За сбережение экспонатов музея сторож М.Я. Белый и уборщица П.К. Дузь в 1944 г. были представлены к награде.
Распоряжением областной управы — органа немецкого оккупационного режима — весной 1942 г. оба музея: исторический и художественный были объединены в один «Историко-художественный музей», директором которого был назначен бывший сотрудник исторического музея профессор П.А. Козар. 2 июня 1942 г. были официально утверждены новое название музея и штат его сотрудников.
При немецком оккупационном режиме сотрудниками исторического музея, кроме упомянутой выше инвентаризации экспонатов, проводились также следующие виды работ: изъятие политической литературы из библиотеки музея, передача церковных музейных ценностей автокефальным церквам, археологические раскопки на Днепре и открытие выставки археологических экспонатов по материалам этих раскопок.
При отступлении немцами был вывезен 1 вагон экспонатов музея.
Ущерб, причиненный немецко-фашистскими захватчиками музею за 1941 —1945 гг., составил 57 млн. руб.
25 октября 1943 г. Днепропетровск был освобожден от немецко-фашистских захватчиков. 19 ноября 1943 г. отдел народного образования Днепропетровского областного исполкома назначает Д.Ф. Красицкого директором исторического музея и с этого момента музей возобновляет свою деятельность.
Начинается восстановление разрушенного здания музея, подготовка новой экспозиции, поиск эвакуированных и вывезенных немцами экспонатов музея. В 1944 г. в здании художественного музея сотрудниками исторического музея была развернута выставка «Великая Отечественая война». К годовщине освобождения города исторический музей возобновил экспозицию в 5 залах своего здания. Экспозиция была построена на сохранившихся фондовых и реэвакуированных материалах. Трудно судить о том, все ли эвакуированные экспонаты были возвращены, т.к. не сохранилась учетная документация — ни остававшаяся в Днепропетровске, ни эвакуированная вместе с экспонатами.
Из вывезенных немцами экспонатов музея найдены и возвращены были единицы.
В 1944—1945 гг. фонды музея пополнялись экспонатами археологических раскопок, проводимых музеем совместно с историческим факультетом Днепропетровского государственного университета и с Институтом Археологии Академии Наук УССР в порожистой части Днепра.
В 1945 г. в 2 комнатах дома Д.И. Яворницкого была создана экспозиция, посвященная Яворницкому.
Павлюкова О.В., науковий співробітник відділу фондів ДІМу
Регіональне і загальне в історії: Тези міжнародної наукової конференції, присвяченої 140-річчю від дня народження Д.І. Яворницького та 90-літтю XIII Археологічного з’їзду (9 листопада 1995 р.). Дніпропетровськ, 1995. — 328 с.